電子潔凈工程的凈化空調系統是整個工程的主要設備之一，通過過濾器的三級過濾機理將輸入潔凈區的空氣控制在規定的潔凈度等級，級別越高凈化效果則越明顯。

企業在選擇凈化調節系統時，應根據自身生產工藝的要求，空氣潔凈等級、空間大小等多重因素考慮集中或分散式調節系統。如產品的生產工藝需連續、潔凈工程面積較大、位置的選址集中、對噪聲及震動要求嚴格的潔凈工程，宜選集中式凈化空調系統。

如要對電子潔凈工程的凈化空調系統電加熱時，宜選用管狀式，位置在高效過濾器的上風側，注意做好防火安全措施。

　　凈化車間送風機組的選擇，可按照凈化空調系統的總風量、阻力值來確定。

　　在建設電子潔凈工程時應合理利用凈化空調回風系統，如操作過程中出現大量有害物質或衛生要求達不到時，應避免使用回風。

　　緩沖區是凈化車間的特殊區域，應注有明顯的標識，且保持關閉狀態。為了保證室內的潔凈度，其出入門不得同時打開，且應設有連鎖裝置。

　　凈化車間的溫濕度應得到很好的控制，相對溫濕度應保證在規定范圍內，噪聲、照明等相關參數也應如此。

　　潔凈工程的凈化空調系統應維持在連續運作狀態，直到清潔維護工作完成為止。

　　凈化車間的建設離不開凈化設備的對空氣進行凈化過濾，從而維持室內潔凈程度。近年來，對潔凈工程的多行業推廣與實施，使得眾多行業的生產環境達到真正的潔凈化。